02
ImmunQTL模块
免疫QTL模块主要查询不同免疫细胞中影响不同
癌症类型的SNP位点。可以通过癌症类型、SNP ID、免疫细胞种类、样本量大小、显著值等条件进行筛选。
例如，我们查询rs2442556位点，可以看到rs2442556在乳腺癌中与巨噬细胞免疫互作显著。
随后，我们还可以绘制不同基因型的癌症样本rs2442556位点对免疫细胞的调控作用。
03
生存曲线模块
与基因表达的生存情况相似，我们也可以查询并绘制SNP位点不同基因型对患者生存的影响。我们以乳腺癌为例，查询在大于500人的样本中显著调控患者预后的位点。
当然，CancerImmunityQTL数据库也可以生成不同基因型患者该位点的生存曲线。
04
GWAS-免疫模块
第三个模块可以查询一个与癌症和另一种常见表型共同相关的遗传变异及其在免疫细胞中的调控作用。例如，通过连锁不平衡（LD）关系得到，在结
直肠癌中TPI1P1上的两个位点与
天冬氨酸转氨酶水平相关，都在B细胞中起到调控作用。本模块突出了癌症与其他表型在某些位点的关联。
以上就是本篇文章【CancerImmunityQTL： 泛癌免疫浸润数据库】的全部内容了，欢迎阅览 ！ 文章地址：http://sicmodule.kub2b.com/quote/78.html
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