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医学信息检索知识点梳理

目录

1.绪论

2.中文数据库检索

3.PubMed检索

4.Web of Science检索

5.NoteExpress文件管理软件

6.学位论文检索

7.电子书检索

8.google网络搜索

9.检索策略

绪论

1.检索基本思路：（例：2010年甲流发病率）

①准确了解背景知识（甲流，甲型h1n1，权威机构，权威作者）

②挖掘隐含的信息线索（卫生部，统计数据）

③切分为多个词语输入（2010 h1n1 发病率）

④选用核心词，省略不重要的词（甲型）

2.文献类型：

①图书：教科书、工具书、专著

②连续出版物：期刊、报纸

③特种文献：标准规范、会议文献、产品资料、专利文献、科技报告、学位论文

【会议文献(conference、proceeding)：比期刊信息更新，但全文较难获取】

【学位论文 (dissertation )：篇幅长、论述循序渐进，实验方法表达详尽】

3.不同文献类型的用途：

①概念、定义、背景知识查找：百科全书、词典、辞海、专著

②事件、数值查找：年鉴、报纸、统计资料等数值数据库

③课题研究内容：期刊、会议文献、学位论文、科技报告

④技术研发、申请专利：专利文献、成果数据库

4.文献的加工深度：

①一次文献（原始文献)

②二次文献 (目录类文献、索引）

③三次文献（教科书、参考工具书、综述）

④零次文献（私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等）

5.违规行为：

①超过正常阅读速度，连续、系统、批量地进行下载。比如在一小时内下载超过百篇以上的全文文献、对某本期刊整本或整期下载。

②使用软件、工具批量下载电子资源，如“网络蚂蚁”或“Flashget”之类网络机器人软件。

6.查准与查全：

①了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断的信息，以解决研究中的具体问题，要求以“准”为主

②申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时，往往需要全面地收集某一主题范围的文献信息，这类课题具有普查追溯的特点，应着眼于“全”

7.常用英文数据库：

①PubMed（北美期刊为主，文摘, 全）

②Web of Science 核心合集（文摘，精）

③Embase (欧洲期刊）

8.常用中文数据库：

①中国学术期刊网络出版总库（即中国知网）（全文）

②万方数据—期刊、会议、学位论文等（全文）

③中文科技期刊数据库（维普，全文）

④中国生物医学文献数据库（即CBM）（文摘）

⑤超星电子书（全文）

⑥西医图书数据库(人民卫生出版社)

9.检索途径：

推荐：分类搜索＋检索词

10.逻辑算符：

①逻辑算符（布尔算符）：与（交集）、或（并集）、非

【运算次序：一般为：not →and →or】

【在一个检索式中同时出现and, or时，如果要先算or的部分，应把or的部分输在前面，或输在一个检索框内。如果在专家检索中输入检索式，应用括号括起or的部分】

②精确匹配符（短语匹配）：“”

③位置算符（邻近算符）：用于限定检索词之间的间隔单词数，有adj, near, N, W等

【tongue w/2 base表示两个检索词中间最多允许插2个词，词序可互换】

④字段限定符

⑤截词符与通配符：

*词尾，替代0个或任意多个字符

, $,#等用于词中、词尾，一个通配符替代一个或0个字符

11.寻找中外文核心期刊：

①科技部中国科技期刊引证报告：http://coreej./，查询中文期刊影响因子、收藏图书馆

②北大中文核心期刊要目总览：http://coreej./，查询“核心期刊”、本专业重要期刊

③外文：JCR，在“Web of Science”的左上角

中文数据库

1.检索策略：

核心概念舌根肿瘤限定篇名（以确保查准）

次要检索词治疗可限主题或文摘

例：舌根肿瘤的治疗——中国知网

“舌根肿瘤”限定在篇名，而“治疗”限定在主题、文摘

使用“模糊查询”以查全同义词

“舌根肿瘤”可同义为舌根癌、舌根瘤，“治疗”可同义为手术、切除、疗法

还有“结果中检索”

因此可先检索“舌根肿瘤”，再检索“治疗”

“分类检索”结合“主题检索”

2.中国知网搜索后：

①可分组浏览，确定核心著者群

②导出题录：选择文献，点击导出

③选中文献，点击阅读，批量预览全文

④查看检索式

⑤分析→文献互引图

3.CBM

①运算次序：NOT＞AND＞OR

②每个框只能输入单个检索词，不允许输入逻辑算符，多个字段组配需分步发送到检索框

③主题词表来自中国中医研究院图书情报研究所新版《中医药学主题词表》

【可通过CBM查询规范的英文主题词名，再去PubMed上面查】

④主题词检索的功能：

将非主题词引见到主题词形式

提供主题词的定义、注释

显示主题词之间的族性关系（上位词、下位词、同位词）

主题索引中提供中、英文两种形式

带*的主题词是重点论述的内容

⑤副主题词：限定规范主题词某一方面研究内容的规范词，例：

诊断：诊断，放射摄影术，放射性核素成像，超声诊断等

治疗: 治疗，药物治疗，放射治疗，外科学，膳食疗法，康复，中医治疗等

病因: 病因学, 病理学, 化学诱导，中医病机等

⑥人工标引速度慢，最新论文未标规范主题词；新词、一些很专指的概念没有对应的主题词

（如舌根癌），因此CBM查文献应同时使用自由词检索以防漏检

先用“主题检索”搜索，再用自由词检索

最后合并两次搜索结果（组合检索式：(#1 or #2)）

⑦加权检索：相关性更强

扩展检索：含这个主题词的“下位词”（更细分类）。若不扩展，就排除了这个主题词的下位词里的内容，只剩归不进下位词的内容

4.维普：

每个框均可输入检索式*、+、-

5.三个中文数据库比较：

5.中文综述检索：

搜“综述”“概述”“进展”“现状”“展望”“回顾”

综述可短时间内了解研究的最新动态、研究分支、确定选题方向、提高研究起点

【英文综述直接在结果中选择Review即可】

PubMed

1.特点：提供检索词智能转换匹配，仅含期刊文献，不含学位论文

2.不同标引的含义：

①[PubMed-indexedfor MEDLINE]：来自MEDLINE，有MeSH字段和摘要的已标引数据

②[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]：来自MEDLINE，无MeSH字段和摘要的1949-1965年间的数据

③[PubMed-inprocess]：来自MEDLINE，尚未经MeSH字段标引的处理中数据

④[PubMed-assupplied by publisher]：非MEDLINE，无MeSH字段标引，直接由出版商提供

⑤[PubMed]：非MEDLINE，无MeSH字段标引

3.检索规则：

①每个框可输入多个检索词，运算符必须大写

②系统默认空格为AND检索，但有字段限定时不拆分

③著者检索[au]：姓全称在前，名首字母在后

④刊名检索[so]：全称或标准缩写

⑤查文章作者全名：[FAU]

⑥PubMed可智能转换匹配，具体匹配语句详见右侧下方的Search Detail

例：livercancer →'liver neoplasms'[MeSH Terms] OR ('liver'[AllFields] AND 'neoplasms'[All Fields]) OR 'liverneoplasms'[All Fields] OR ('liver'[All Fields] AND'cancer'[All Fields]) OR 'liver cancer'[All Fields]

⑦左侧可进一步在结果中筛选

⑧凡是标题带[]的，就不是英文文献！下面会告诉语种

⑨检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式，如：#1 OR #2，#1 AND child

4.字段含义说明

5.MeSH词表查规范词

选“MeSH”数据库，而不是“PubMed”

例：在“MeSH”里查“liver cancer”，点进去，出现“上位词”“下位词”“款目词（不规范词）”

主题词检索后应补查最新一年的未整理主题词的文献，再用检索历史合并检索结果

查找杂志规范名：选“NLMcatalog”数据库，而不是“PubMed”

6.检索结果导出：

Send to→MEDLINE→txt【导出后可直接导入题录到NoteExpress】

Send to→summary→csv【导出后可用excel打开，然后复制标题到谷歌翻译，快速浏览搜索结果】

7.PMC (PubMed Central)

生命科学免费期刊资源中心

免费提供900多种期刊的10多万篇全文

其中部分文献被PubMed涵盖

8.分析PubMed结果：

德国网站GoPubMed：www.goPubMed.com

可提供时间、国家、城市、刊物分析

Web of Science

1.检索范围：期刊、技术专利、会议录、化学反应、Internet资源、文献分析工具，不含学术论文

“更多设置”：勾选第一个、第四个即可，其他的与医学无关

2.其他功能：（页面最上方）

①JournalCitation Reports(JCR)（期刊引用报告数据库）：与科学计量学工具结合，有分析功能

②EssentialScience Indicators（基本科学指标数据库）：提供了对科学家、机构、国家/地区和期刊进行排序的数据；依据期刊文章出版数量和引文数据，探索科学绩效统计和科学趋向数据；确定特定研究领域的研究成果和影响；评估潜在的雇员、合作者、评审人和同行

③InCites（基于引文的综合性科研评估工具）：评估数据来源于高质量的Web of Science引文数据库各学科领域30年的数据；从宏观的国家、机构、领域分析到微观的每篇论文、每个科研人员的绩效评估

3.检索方式：-

4.检索规则：

①在检索框中输入检索词（关键词、著者姓名、刊名等）。词组检索可使用双引号

②支持AND、OR、NOT的逻辑组配，同时使用时遵循NOT＞AND＞OR的运算顺序

③提供NEAR/X位置算符，表示由该运算符连接的检索词之间相隔指定数量的单词 （X为最大单词数）；提供SAME位置算符，表示检索词出现在同一个地址中

④著者检索输入格式为：SmithJP

⑤通配符：可用于词前、词中或词尾，* 替代多个字符； ？替代1个字符；$替代0个或1个字符

⑥检索后再左侧“精炼检索结果”，可继续选择（类似PubMed左边，但可选性更高）

⑦获取全文：“出版商处的全文”、“S-F-X”（校园网可获得的）

⑧左下角“分析检索结果”

⑨CitedReferences越查越旧，Times Cited越查越新，RelatedRecords越查越深

5.检索字段选择：

①主题——包括标题、摘要、关键词字段TS=Topic

②标题TI=Title

③作者——作者、书籍作者、书籍团体作者、团体作者AU=Author

④团体作者——机构作者、书籍团体作者GP=Group Author

⑤出版物名称——期刊标题、书籍标题、丛书标题等SO=Source

⑥出版年PY

⑦著者所在机构地址（缩写）AD=Address；SA=Street Address；CI=City；PS=Province/State；CU=Country

⑧原文语种

⑨文献类型

⑩会议——会议标题、会议地点、会议日期、会议发起人

例：TI=(constipation) AND TS=(microflora ORmicrobiota OR microbiome) AND PY=(2013-2013)

6.检索结果导出：

①把搜索结果“保存至Endnote”，会保存为一个ciw格式的文件

②NoteExpress导入题录，当前过滤器选“Web of Science”，文件格式不支持？选“任意文件”。这样就可以导入了

7.影响因子：

影响因子＝该刊前两年发表论文在当年被引用的总次数÷某刊前两年发表的论文总数

NoteExpress

1.文献管理软件：

①NoteExpress：快速收集、有序存储、建立可检索的个人文献库；题录关联全文，随读随记；多角度归类、分析、筛选文献；随写随引，自动调整格式顺序

②EndNote：只有网络版，全文不能附在题录后，无法进行笔记管理，不能添加标签

③医学文献王

2.下载地址：

http://www.library.fudan.edu.cn→常用数据库→

http://www.library.fudan.edu.cn/main/info/3242.htm（选教育网镜像比较快）

3.使用方法：

①文件→新建数据库→“题录”右键→添加文件夹

·题录：文献的篇名、作者、关键词等简要信息

·笔记：用户对每篇文献所作的摘记，感想等

·检索：用户所有的检索指令

·组织：文献按作者、机构、关键词等建立索引

②题录的导入：

·批量导入题录：先在数据库中检索（如中国知网/PubMed）→（把所有的文章全选/一个一个选）→导出/Send to→以NoteExpress/Medline的格式保存

·在浏览器中检索：包括CNKI，维普，ProQuest，PubMed，SciDirect（Elsevier），springer等数据库→点击Ne标签来添加到题录【缺点：浏览器中没有Ne标签的文章不能导入】

·在线检索：先显示50条，逐渐再扩展，适合单篇文献查找，不适合大批量

·手工录入：新建题录的关键词、作者等如果不止一个，用回车键分隔

③题录与全文或其他文件关联：

·待关联题录右键→添加附件

·导入全文→待关联题录右键→在线更新→自动更新→选择在线数据库→查找更新→应用更新

·导入全文之后，软件会自动抽取标题（文件名乱七八糟都无所谓），但非pdf的文件（如中国知网的caj）需要手动把文件名改成文章标题

④下载全文：待下载题录右键→下载全文→选择全文数据库

⑤题录可标注“优先级”、设置标签、移动复制到其他文件夹（自动关联，统一修改）、查重（检索→查找重复题录）、多角度归类（左边“组织”里查找）、统计分析（文件夹右键→文件夹信息统计）

⑥表头的修改：鼠标至表头处右键→自定义，可调整表头内容、顺序

⑦笔记：可关联多个题录，一个题录可有多个笔记

⑧插入网页信息：在IE浏览器里面，右键→add URL to NoteExpress（先安装IE插件）

4.随写随引：

安装word插件：在NE中点“工具”→选项→扩展

①Word自动集成进去，点击“插入笔记”把笔记内容插入（不如复制再粘贴方便）

②点击“插入引文”或“检索”的方式生成引文

③“格式化”变成想要的格式，如GBT_7714-2005，也可以按杂志社的要求自定义样式（工具→样式→样式管理器→双击“编辑选中的样式”→左边“题录-模板”可修改字体斜体等）

④插入脚注：样式编辑器中点击左边“注释”→右边“生成注释列表”

⑤文章或题录改动后，点“同步”来更新

⑥“去除格式化”要点“清除域代码”，这样可以去除参考文献与引文的关联，但不能再同步

学位论文检索

1.ProQuestDissertations & Theses(PQDT)：

①美国ProQuest公司出版的欧美博硕士学位论文库，收录欧美1000余所大学的160多万篇学位论文，是目前广泛使用的学位论文数据库

②收录年代长，从1861年开始；更新快，每周更新；

③1997年以来的部分论文不但能看到文摘索引信息，还可以看到前24页的论文原文

④国内三个镜像站有全文（北大、交大、中信所）

⑤http://search./dissertations/index?accountid=10025

2.检索规则：

①逻辑算符：and (与)、or (或)、 not(非)

②截词符：? 替代一个字符，* 替代任意个字符

③词组短语：“”精确匹配

④字段限定的格式：字段代码（检索词）例： ti（nanocarrier）

AB（文摘） ADV（导师） AU（作者）

DG（授予学位） LA（语种） TI（标题）

SCH（学校） SU（主题） YR（年份）

3.检索结果导出：

导出为RIS格式，保存，在NoteExpress中导入题录时，选择RefMan（RIS）过滤器

4.中国大学学术论文：可通过万方或中国知网查找

电子书检索

1.常用数据库：

①读秀知识库

②超星数字图书馆

③CALIS中国高校教学参考书全文数据库

④方正阿帕比电子图书

⑤方正阿帕比工具书库

⑥MyiLibrary 电子书

⑦EBSCOe-book 电子书

⑧Springerlink电子书

⑨OVID电子书

2.可检索内容：

①寻找课题专业相关的图书：图书搜索（主题词，书名，分类浏览）

②寻找某本特定的图书：图书搜索（书名，作者）

③寻找原理、技术细节、方法等知识：图书搜索：目次（章节名）、全部字段搜索

④寻找概念定义、具体事件等知识点：知识搜索（全文）

Google搜索

1.检索规则：

①必须检索：无需and，两词间空格默认and匹配

②或者检索：OR必须大写

③排除检索：用-表示，但减号前必须留一空格

④短语检索：“”精确匹配

⑤对大小写不敏感

⑥检索位置限定：

·标题：allintitle

·网址：allinurl

·内文：allintext

·链接：allinanchor

例1：allinurl:nih搜索网址内含单词nih的网页

例2：查找2010年我国卫生部发布有关甲流的发病数，仅在moh.gov.cn（中华人民共和国卫生部网站）中搜索）

⑦文件类型限定：filetype:文件名后缀

支持13种非HTML文件的搜索：pdf，doc，rtf，ppt，xls，swf，ps等

例：'nanocircuits' evaluation filetype:pdf

⑧禁用词：最常用的字符以及数字和单个字母等高频词，在检索时系统自动忽略不作检索。如果必须检索禁用词时可用“”，包括：of，is，by，i，的，为，http，.com，3等

例：“worldwari”

⑨高级检索：搜索框旁边的▽

优点：网页全文搜索，对于细小、专指度高的，文献较少的知识点查找较有效（指标、参数、表格等）

2.网站与网页：

①网页：浏览器显示的一个页面

②网站：一个机构/个人在网上提供浏览或服务的站点，一个网站包括多个页面/网页

搜索某一网站的内容：site:……

例：2010 甲型h1n1流感 发病数 site:moh.gov.cn

3.查找本专业网站：

①查找类似网站（Google）

例：查找与美国国立卫生研究院类似的网站，输入related:www.nih.gov

②查找链接网站（Google）

例：查找含美国国立卫生研究院链接的网站，输入link:www.nih.gov

③查找相关网站（ODP目录查询）：www.dmoz.com

4.搜索引擎与目录网站的比较：

①搜索引擎：目标明确、主题较狭窄、知识点、事实数据、文献、新闻等网页查找

②分类目录检索：目标模糊、主题较宽泛、查某专业重要网站

5.免费电子期刊查询：

①Free Medical Journals　http://www.

②Directory of Open Access Journals　http://www.

③HighWire Press　http://www.

④学术机构网站

例：美国微生物协会（ASM　http://www.），提供12种协会免费电子期刊浏览

检索策略

1.查准与查全：

①查准适用范围：了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断信息，以解决研究中的具体问题

②查准率：检出相关文献数量÷检出文献总数，可计算

③查全适用范围：立项查新、撰写综述、申请发明、申报成果以及鉴定科研成果时，需要全面地收集某主题范围的文献以鉴定其新颖性，具有普查追溯的特点

④查全率：检出相关文献数量÷数据库中全部相关文献数，检索者难以计算

2.提高查准率的方法：

①仅在数据库的某个或某几个子集中检索

②将检索词限定到标题、关键词字段

③变and为邻近算符：near, adj…，或副主题词

例：asthma and therapy 改为asthmaadj9 therapy (OVID)、asthma/therapy (PubMed)

④使用精确运算符' '，精确匹配

⑤限定主要主题词：加权（CBM）/restrictto major subject headings（PubMed）

3.提高查全率的方法：

①通过涵盖词形变化：

·查全单词的不同拼写方式，例：fibre OR fiber

·查全缩写与全称，例：MRI OR Magnetic Resonance Imaging

·使用截词符，例：transplant*

·查全错别字，例：肾综合征出血热 OR 肾综合症出血热

·查全所有格形式，例：tongue adj2 base（OVID）、tongue near/2 base (Web of Science)

②通过查全子概念：

·用OR连接子概念，例：pulmonaryblastoma OR pleuropulmonary blastoma

·变词组检索为邻近检索，例：acute pancreatitis改为acute NEAR/2 pancreatitis

·变邻近检索为AND检索

③通过改用上位概念检索词：

例：干扰素α-1b 改用 干扰素α

④通过调整检索字段：

相关度：篇名＞关键词＞主题词＞摘要＞全文

⑤通过查全数据库：多库、跨库、跨类

4.如何平衡查准率和查全率

①使用MeSH词表选词检索（若没有对应MeSH词的概念，使用上级概念对应的MeSH词），再结合自由词

②核心概念、前提概念限定篇名、关键词；次要概念、集合概念限定主题、文摘

例：篇名=脓毒症 AND 主题=治疗

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